大腸息肉的處理原則是發現息肉即刻摘除。目前摘除息肉的方法主要有內鏡下行各種摘除法。
根據息肉的形態、大小、數量和蒂的有無、長短粗細而分別采用：
①高頻電凝圈套切除法：主要用于有蒂息肉；
②高頻電凝灼除法：主要用于多發半球狀小息肉；
③高頻電凝熱活檢鉗法：目前極少應用，主要被②④法取代；
④活檢鉗除法：主要用于單發或少數球狀小息肉，簡便易行，又可取活組織病理檢查；
⑤激光氣化法和微波透熱法；適于無需留組織學標本者；
⑥粘膜剝離嵌除法：主要用于扁平息肉或早期癌患者；
⑦“密接”摘除法，主要用于長蒂大息肉，難以懸于腸腔者采用大息肉密接腸壁電凝切除法。
⑧分期批摘除法，主要用于10～20顆以上息肉患者無法一次切除者。
⑨內鏡、外科手術聯合治療法，主要用于息肉病患者，即將息肉稀疏區以手術切除，這樣即可達到治療目的，又可維持大腸正常功能。
由于大腸息肉，特別是腺瘤性息肉已被學者公認為癌前期病變，所以，大腸息肉患者的定期隨訪已被提到防治早期大腸癌的高度來認識。大腸息肉，尤其腺瘤息肉、定期隨訪是防止息肉惡變的重要一環。
息肉的再檢出率較高，國外報道13%～86%不等，新檢出的息肉除部分為殘留息肉再次生長的復發息肉外，一些為大腸新生息肉和遺漏息肉。為保持腸道無息肉狀態，防止大腸癌的發生，制定一個經濟有效的隨訪時間是必要的，目前國際上對腺瘤隨訪時間是必要的，目前國際上對腺瘤隨訪提出了多種方案。其中在波士頓召開的第三次國際大腸癌會議中大腸腺瘤組討論建議的方案較為詳細。他們指出腺瘤患者在腺瘤切除后再發新腺瘤及局部腺瘤再復發的危險不一，故應區別對待：凡是單個、有蒂（或廣基但＜2cm管狀腺瘤），伴輕或中度不典型增生的腺瘤屬低危險組。凡有以下情況之一者屬高危險組：多個腺瘤、腺瘤直徑＞2cm，廣基的絨毛狀或混合型腺瘤，腺瘤有重度不典型增生或伴原位癌，腺瘤已有浸潤性癌變者。高危險組的隨訪方案是腺瘤切除，3～6月作內鏡檢查，如陰性隔6～9月再檢查1次，如再次陰性可隔1年檢查，如仍為陰性，每3年再檢查1次，但期間每年需作大便潛血檢查。低危險組腺瘤在切除腺瘤后1年復查，如陰性可每隔3年檢查1次，共2次，然后每隔5年檢查1次，但在隨訪時間，每年須作大便潛血試驗。復查中一旦發現息肉即行內鏡摘除。
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